熒光定量PCR儀是一種用于分子生物學(xué)檢測的高靈敏度、高特異性的分析儀器。通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針,對PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))產(chǎn)物進行標(biāo)記和跟蹤,實時監(jiān)測反應(yīng)過程中的熒光信號變化。在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程。隨著反應(yīng)循環(huán)數(shù)的增加,目標(biāo)DNA的擴增會導(dǎo)致熒光信號的增強。通過檢測熒光信號的變化,可以繪制出熒光強度相對于循環(huán)數(shù)的擴增曲線,從而實現(xiàn)對靶DNA的定量分析。
熒光定量PCR儀其主要特點:
一、準(zhǔn)確性高
熒光信號強度與拷貝數(shù)相關(guān)
熒光定量PCR通過對熒光信號的精確檢測來確定目標(biāo)核酸的初始量。熒光信號強度與PCR反應(yīng)體系中目標(biāo)核酸的拷貝數(shù)成正比關(guān)系。在PCR反應(yīng)的指數(shù)期,每一個循環(huán)的熒光信號增加量都與起始模板量直接相關(guān)。例如,在檢測病毒核酸載量時,熒光信號強度能夠準(zhǔn)確反映病毒基因組的初始拷貝數(shù),從而為病毒定量提供可靠的數(shù)據(jù)。
精密的溫度控制
儀器具備高精度的溫度控制系統(tǒng),能夠精確控制PCR反應(yīng)的各個階段(變性、退火、延伸)的溫度。溫度的準(zhǔn)確性對于保證PCR反應(yīng)的效率和特異性至關(guān)重要。例如,在人類基因檢測中,精確的退火溫度可以確保引物與模板的特異性結(jié)合,避免非特異性擴增,從而提高檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。
二、靈敏度高
低拷貝數(shù)檢測能力
熒光定量PCR儀能夠檢測到極低拷貝數(shù)的目標(biāo)核酸。它可以檢測到單拷貝或幾個拷貝的核酸分子,這對于微量核酸的檢測非常重要。例如,在腫瘤研究中,可以檢測血液中循環(huán)腫瘤細(xì)胞中的微量核酸標(biāo)志物,有助于早期腫瘤診斷和病情監(jiān)測。
熒光檢測的高靈敏度
儀器采用高靈敏度的熒光檢測技術(shù),如熒光染料法或熒光探針法。熒光染料可以特異性地結(jié)合雙鏈DNA,在PCR反應(yīng)過程中,隨著雙鏈DNA的逐漸增加,熒光信號也逐漸增強。熒光探針則通過與目標(biāo)核酸序列特異性結(jié)合并發(fā)出熒光信號,其檢測靈敏度更高。例如,TaqMan探針技術(shù)可以檢測到單分子水平的核酸靶標(biāo)。
三、速度快
實時檢測
熒光定量PCR儀能夠在PCR反應(yīng)過程中實時檢測熒光信號,不需要像傳統(tǒng)PCR那樣在反應(yīng)結(jié)束后進行電泳分析等后續(xù)步驟。這樣可以大大縮短檢測時間,一般整個檢測過程可以在1-2小時內(nèi)完成。例如,在食品微生物檢測中,能夠快速檢測出食品中是否含有致病微生物。
高通量檢測
許多熒光定量PCR儀可以同時處理多個樣品,一次可以檢測96個或更多樣品。這種高通量的特性使得它在大規(guī)模檢測任務(wù)中具有很大的優(yōu)勢,如在疾病篩查、藥物研發(fā)等領(lǐng)域可以快速處理大量樣本。
四、特異性強
引物和探針的特異性
通過使用特異性的引物和探針,熒光定量PCR儀可以精確地檢測目標(biāo)核酸序列。引物是根據(jù)目標(biāo)核酸的特定區(qū)域設(shè)計的短DNA片段,只有在引物結(jié)合位點與模板完q匹配時才能引發(fā)PCR反應(yīng)。探針則是基于目標(biāo)序列設(shè)計的熒光標(biāo)記的寡核苷酸,它與目標(biāo)序列特異性結(jié)合并產(chǎn)生熒光信號。例如,在檢測某種病原體的特定基因型時,特異性的引物和探針可以區(qū)分不同亞型的病原體。
減少非特異性擴增
儀器可以通過優(yōu)化PCR反應(yīng)條件(如溫度、引物濃度等)來減少非特異性擴增。非特異性擴增會導(dǎo)致假陽性結(jié)果,影響檢測的準(zhǔn)確性。熒光定量PCR儀可以利用其高靈敏度和特異性的特點,結(jié)合熔解曲線分析等方法,識別和排除非特異性擴增產(chǎn)物。例如,在基因表達分析中,準(zhǔn)確的檢測結(jié)果依賴于特異性地檢測目標(biāo)基因的表達,而不是非特異性的背景信號。